Инквизиция действует как тайная полиция Империи, борющаяся с любыми врагами и опасностями, внешними или внутренними, которые могут угрожать царству Бога-Императора. Инквизиторы, как правило, наделены чрезвычайными полномочиями действовать непосредственно от лица Императора и сами по себе олицетворяют закон Империума.  Кроме того, в полномочия Инквизиторов входит возможность требовать помощи и содействия любых организаций Империи — Имперской Гвардии и Флота, орденов Астралодесанта и т. д.

Базовая единица Инквизиции — инквизитор. Такое деление определяет всю структуру и методы работы этой организации. В то время как прочие организации Империи погибают под тяжестью бюрократической машины, Инквизиция от неё свободна. Каждый отдельно взятый инквизитор вправе действовать так, как он считает единственно возможным, привлекая на свою сторону любые средства. Инквизиция имеет доступ к любым ресурсам Империи: к войскам, архивам, оружию, средствам связи, транспорту и т. д. Каждый инквизитор в отдельности олицетворяет и обладает всем могуществом этой организации. Символом полномочий инквизитора является инсигния (печать) инквизитора.